Background. Approximately 5% of people infected with Mycobacterium tuberculosis progress to tuberculosis (TB) disease without preventive therapy. There is a need for a prognostic test to identify those at highest risk of incident TB so that therapy can be targeted. We evaluated host blood transcriptomic signatures for progression to TB disease. Methods. Close contacts (≥4 hours of exposure per week) of adult patients with culture-confirmed pulmonary TB were enrolled in Brazil. Investigation for incident, microbiologically confirmed, or clinically diagnosed pulmonary or extrapulmonary TB disease through 24 months of follow-up was symptom triggered. Twenty previously validated blood TB transcriptomic signatures were measured at baseline by real-time quantitative polymerase chain reaction. Prognostic performance for incident TB was tested by receiver operating characteristic curve analysis at 6, 9, 12, and 24 months of follow-up. Results. Between June 2015 and June 2019, 1854 close contacts were enrolled. Twenty-five progressed to incident TB, of whom 13 had microbiologically confirmed disease. Baseline transcriptomic signature scores were measured in 1789 close contacts. Prognostic performance for all signatures was best within 6 months of diagnosis. Seven signatures (Gliddon4, Suliman4, Roe3, Roe1, Penn-Nicholson6, Francisco2, and Rajan5) met the minimum World Health Organization target product profile for a prognostic test through 6 months and 3 signatures (Gliddon4, Rajan5, and Duffy9) through 9 months. None met the target product profile threshold through ≥12 months of follow-up. Conclusions. Blood transcriptomic signatures may be useful for predicting TB risk within 9 months of measurement among TB-exposed contacts to target preventive therapy administration. Keywords. biomarkers; blood; prognostic; transcriptomic; tuberculosis
Assinaturas Transcriptômicas da Progressão para a Tuberculose Entre Contatos Próximos no Brasil
Introdução: Aproximadamente 5% das pessoas infectadas por Mycobacterium tuberculosis progridem para a tuberculose (TB) sem terapia preventiva. Existe uma necessidade de testes prognósticos para identificar aqueles com maior risco de desenvolver a TB, de modo que a terapia possa ser direcionada. Avaliamos assinaturas transcriptômicas no sangue do hospedeiro para a progressão para a tuberculose.
Métodos: Foram recrutados contatos próximos (≥4 horas de exposição por semana) de pacientes adultos com TB pulmonar confirmada por cultura no Brasil. A investigação de TB latente, confirmada microbiologicamente ou diagnosticada clinicamente, tanto pulmonar quanto extrapulmonar, foi realizada durante 24 meses de acompanhamento, com base nos sintomas. Vinte assinaturas transcriptômicas previamente validadas para a TB no sangue foram medidas no início do estudo por reação em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real. A performance prognóstica para a TB latente foi testada por análise da curva característica de operação do receptor (ROC) aos 6, 9, 12 e 24 meses de acompanhamento.
Resultados: Entre junho de 2015 e junho de 2019, 1854 contatos próximos foram recrutados. Vinte e cinco progrediram para TB latente, dos quais 13 tinham a doença confirmada microbiologicamente. As pontuações das assinaturas transcriptômicas de base foram medidas em 1789 contatos próximos. A performance prognóstica para todas as assinaturas foi melhor nos primeiros 6 meses após o diagnóstico. Sete assinaturas (Gliddon4, Suliman4, Roe3, Roe1, Penn-Nicholson6, Francisco2 e Rajan5) atenderam ao perfil mínimo do produto alvo da Organização Mundial da Saúde para um teste prognóstico até 6 meses, e 3 assinaturas (Gliddon4, Rajan5 e Duffy9) até 9 meses. Nenhuma delas atendeu ao limite do perfil do produto alvo após ≥12 meses de acompanhamento.
Conclusões: As assinaturas transcriptômicas no sangue podem ser úteis para prever o risco de TB dentro de 9 meses de medição entre contatos expostos à TB, com o objetivo de direcionar a administração de terapia preventiva.
Palavras-chave: biomarcadores; sangue; prognóstico; transcriptômica; tuberculose.
- Data de Publicação: 06/05/2024
- Autores: Simon C Mendelsohn , Bruno B Andrade , Stanley Kimbung Mbandi , Alice M S Andrade , Vanessa M Muwanga , Marina C Figueiredo , Mzwandile Erasmus , Valeria C Rolla , Prisca K Thami , Marcelo Cordeiro-Santos , Adam Penn-Nicholson , Afranio L Kritski , Mark Hatherill , Timothy R Sterling , Thomas J Scriba , the RePORT–South Africa and RePORT–Brazil Consortia