Contexto:
A estratégia “End TB” da Organização Mundial da Saúde exige novas ferramentas para identificar indivíduos com alto risco de progressão da infecção por Mycobacterium tuberculosis para a doença ativa. Embora várias assinaturas transcriptômicas do hospedeiro tenham sido desenvolvidas, o grande número de genes envolvidos dificulta sua implementação em cenários com recursos limitados. Há uma necessidade urgente de biomarcadores mais simples e parcimoniosos que possam ser facilmente transladados para plataformas de diagnóstico no ponto de cuidado.
Resumo:
Métodos: Desenvolvemos uma assinatura transcriptômica de 2 genes (Silveira-Mattos-2 ou SM2) utilizando dados de sequenciamento de RNA de uma coorte de adolescentes sul-africanos. A assinatura, que consiste na razão da expressão de GBP5 e KIF1B, foi validada por RT-PCR quantitativo em coortes independentes da África do Sul, Etiópia, Gâmbia e Brasil (RePORT-Brasil).
Resultados: A assinatura SM2 discriminou significativamente entre progressores e não progressores até dois anos antes do diagnóstico de TB. Nas coortes de validação, seu desempenho prognóstico (AUC 0,70 dentro de 12 meses do diagnóstico) foi equivalente a assinaturas mais complexas, como a assinatura ACS de 16 genes. Na coorte brasileira, a assinatura também mostrou alta precisão na identificação de casos de TB ativa em comparação com contatos saudáveis.
Conclusão: A assinatura SM2 oferece uma abordagem robusta e simplificada para prever a progressão da TB. Devido à sua natureza parcimoniosa (exigindo apenas dois genes), é uma candidata ideal para o desenvolvimento de testes de ponto de cuidado baseados em PCR de baixo custo em países de alta carga.
Palavras-chave: Tuberculose; Infecção latente; Biomarcadores; Transcriptoma; Prognóstico; PCR.
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- Data de Publicação: 27/11/2019
- Autores: Yukari C. Manabe1 , Bruno B. Andrade2,3,4 , Nikhil Gupte1,5 , Samantha Leong6 , Manisha Kintali6 , Mitch Matoga7 , Cynthia Riviere8 , Wadzanai Sameneka9 , Javier R. Lama10 , Kogieleum Naidoo11,12, Yue Zhao13, W. Evan Johnson13, Jerrold J. Ellner6 , Mina C. Hosseinipour7,14, Gregory P. Bisson15, Padmini Salgame6 , Amita Gupta1 for the ACTG A5274 REMEMBER and NWCS 408 Study Team
